Saat ini, STT Sriwijaya memiliki dua program studi yakni:
- Sarjana Teologi (S.Th). Prodi Teologi diperuntukkan bagi mereka yang terbeban melayani di jemaat secara penuh. Waktu perkuliahan ditempuh selama lima tahun dengan sepuluh semester.
- Pendidikan Agama Kristen (S.Pd). Prodi Pendidikan Agama Kristen diperuntukkan bagi mereka yang terbeban melayani sebagai guru agama di sekolah. Waktu perkuliahan ditempuh selama lima tahun dengan sepuluh semester.