Saat ini, STT Sriwijaya memiliki Tiga program studi yakni:
- Sarjana Teologi (S.Th). Prodi Teologi diperuntukkan bagi mereka yang terbeban melayani di jemaat secara penuh. Waktu perkuliahan ditempuh selama lima tahun dengan sepuluh semester.
- Pendidikan Agama Kristen (S.Pd). Prodi Pendidikan Agama Kristen diperuntukkan bagi mereka yang terbeban melayani sebagai guru agama di sekolah. Waktu perkuliahan ditempuh selama lima tahun dengan sepuluh semester.
- Magister Teologi (M.Th). Prodi Magister Teologi diperuntukkan bagi mereka yang ingin memperdalam ilmu teologi secara akademik dan kontekstual guna memperkuat pelayanan di gereja maupun lembaga-lembaga Kristen. Program ini bertujuan untuk menghasilkan lulusan yang memiliki kemampuan penelitian teologis yang mendalam, pemikiran kritis, serta kepekaan pastoral terhadap persoalan gereja dan masyarakat.